当下，国防部长里昂忙飞快地按下电话号码，接通了白宫的内线电话。
总算接通了电话，当国防部长里昂将这边的情况报告给米国总统奥黑马以后，本来想将卫星截图影像传送过去，可奇怪的是，那一段古怪圆球摧毁“希柯马”星人太空母舰和整支反重力飞机碟战斗群的影像视频，竟然完全消失了，变得一片空白，就仿佛从没出现过一般。
这个意外的结果，让国防部长里昂和一众军官目瞪口呆，也让米国总统奥黑马感到惊疑不定，若不是国防部长里昂口口声声地向他保证，这件事情是真实的，并且还拿他自己的脑袋担保，恐怕奥黑马会撤了他的职！
就在国防部长里昂和米国总统奥黑马一众感到头晕脑乱之时，屏幕上又出现了另外一幕情景。
只见漂浮在海面上那个古怪的金属大圆球，突然飞快地旋转了一下，然后从球体的一侧，突然出现了一道类似舱门的东西，一艘人类的阿尔文微型潜水艇，从那舱口处位置“弹”了出来，落到了海面上。
然后，那个古怪的金属大圆球，再度从海面上一旋转，关闭了舱门，然后迅速往深海中潜了下去，转眼之间，只遗留下一个盘旋的旋涡，并慢慢消失掉了…
与此同时，海面上那艘被“弹”出来的阿尔文微型潜水艇，顶上的舱门被推了开来，从里面爬出了两个人来。
其中一个，正是米国海军陆战队的，另外一个，则是那名中年海军军官！
两人爬出潜水艇以后，抬头怔怔地望着从天空中划落下，如同烟花飞散一般的太空母舰碎片残骸，一言不发，眸子里却闪烁着无比兴奋和难以相信的目光。
“噢！天啊…那是“尼米兹”号的杰森舰长！！他，他怎么会在那里？他旁边那家伙是谁？”国防部长里昂突然认出了那名海军军官，当下无比惊讶地叫了起来。
而凯斯上士和杰森舰长并不知道他们已经成了万众瞩目的人，依然出神地仰望天空，心情久久不能平静下来…
因为，之前他们驾着阿尔文微型潜水艇，一路将云龙送到了海底深处的某个位置以后，云龙竟然要求停了下来。
然后，云龙换上深海潜水服，进入了底舱的eve发射舱里，要求杰森舰长将那台eve潜水器发射出去。
（注：eve潜水器，一种先进的水下潜行装置，米国海军特种部队才有列装，在游戏使命召唤中出现过。）
杰森舰长虽然不知道云龙想要干什么，但是他依然按照他的要求，将eve发射舱发射了出去。
而云龙便随着那台eve发射舱，迅速消失在了黑暗的深海之中。
在等候了大约半个多钟头之后，突然一个巨大的圆球状金属物体迅速向阿尔文微型潜水艇靠近过来，并突然将之“吞没”了进去。
正当凯斯上士和杰森舰长惊魂未定时，头顶却传来了云龙的声音：“两位，这东西就是拿来对付外星人的武器，自动攻击程序已经设定好，你们只需要坐稳，然后看热闹就可以了！”
说完，云龙的声音就消失了，然后，接下来发生的一切，就是前面那匪夷所思的一幕…
而对于海上和陆地发生的一切，似乎已经跟云龙无关了，因为这个时候，他已经在“罪恶火花”的引导之下，进入了隐藏在圣莫尼卡湾深海的岩石深层中，那上古“先驱”遗留下来的遗迹之中。
根据“罪恶火花”的指引，云龙必须要从潜到这里的海底，启动“超重力光子传输器”，才能够进入先驱遗留在地壳深处的“圣堂”，进行第三阶段的基因强化工程！
在启动“超重力光子传输器”以后，云龙按照“罪恶火花”的提示，进入了那闪烁着绿光的重力舱内。
当重力舱一关闭起来以后，云龙登时觉得，四周围的空气，突然变成了巨大的压力，如同一座小山一般，重重地压在了自己的身体上！
这突如其来的重压，差点就让云龙喘不过气来，他全身的肌肉已经全部绷紧，就连骨骼亦被压得咯咯作响，同时他不得不张大了嘴巴拼命呼吸着，这种难以忍受的超级重力，让他感到十分痛苦。
这时“罪恶火花”提醒他道：“主人，您忍一忍吧！这是高达100g的超重力，想要进入先驱的圣堂，必须先通过超重力的的考验，才能够将您的身体状态，调整到能够适应三阶段的基因强化的程度！”
“哦！我忍！我忍！”云龙总算明白过来，为什么自己必须要经历不同阶段的基因强化工程，如果没有之前的阶段，自己的身体根本承受不了这高达100g的恐怖重力。
要知道，即使是最优秀的人类战斗机飞行员，在经过长时间的艰苦训练以后，最多只能够承受8―15g的重力，而云龙却要支撑100g的重力，这几乎是将上万kg的重量压在他的身体上！
也不知道时间过了多久，当云龙被这恐怖的超重力压得快要窒息时，耳朵边终于响起了“罪恶火花”的声音：“好了！主人，超重力负荷已经过载完成，现在，我要启动光子传输器了！你要准备好了！”
“嗯，我，我准备好了！“云龙气喘吁吁地应了一声。
“那好！我启动了！”“罪恶火花”又说了一声，云龙只觉得在自己眼前迸发出一团耀眼的绿光，然后，更加可怕的重力再度压挤到了自己身体上。
这一次，云龙再也忍受不住了，直接闷哼一声，很干脆地晕了过去…
而“罪恶火花”好象已经预料到会有这样的结果，依然有条不紊地执行着程序。
很快，云龙的身体被一团绿光包裹了起来，并迅速地被送如了一个开启的绿色光环之中，然后，化为一蓬刺眼的绿芒，身体迅速拉长…“蓬！”一声，消失在了深海之中！